La colección del Instituto se conserva hoy en un singular edificio neomudéjar construido entre 1889 y 1889 para ser  la residencia particular de Don Guillermo y Doña Adelaida. Entre sus más de 8.000 piezas (armas, cerámicas hispano-árabes, cuadros, azabaches, etc.), se encuentra una de las colecciones de arte andalusí más importantes, y posiblemente más desconocidas, del mundo. Además, el Instituto conserva en su biblioteca un importante archivo de 40.000 documentos, desde los Reyes Católicos hasta el siglo XIX, y un importante fondo fotográfico, compuesto por más de 10.000 originales de los siglos XIX y XX en distintos soportes.